Šešelj je, naime, tada dva tjedna prije početka suđenja započeo štrajk glađu tražeći da se brani sam i da mu se osigura financiranje obrane, a raspravno vijeće na to je odgovorilo odlukom da mu trajno nametne branitelje po službenoj dužnosti, ocjenjujući da Šešeljevo ponašanje predstavlja značajno ometanje sudskog postupka. U prosincu, nakon što je postalo očigledno da je Šešelj ugrozio svoje zdravlje ustrajavanjem na jednomjesečnom štrajku glađu, Žalbeno vijeće poništilo je i početak suđenja i niz odluka donesenih uoči početka suđenja uključivši i odluku da mu se nametne branitelj te uvodne riječi tužiteljstva. Prije godinu dana haško je tužiteljstvo u uvodnim riječima poručilo da je Šešelj, zajedno s drugim sudionicima zajedničkog zločinačkog pothvata, pokušao ostvariti cilj uspostave nove homogene srpske države na dijelovima Hrvatske, BiH i same Srbije kroz rašireni progon, provođen pod patronatom države, koji je uključivao ubojstva, deportacije, zlostavljanja, pljačku i uništavanje imovine građana. U optužnici ICTY stoji da je Šešelj na području BiH i Hrvatske bio odgovoran za (citiramo):
- Dugotrajno i rutinsko zatvaranje i zatočenja civila
- Stalno mučenje, premlaćivanje i ubijanje zatočenih ili deportacija i nasilno preseljenje stanovništva
- Dugotrajan i čest prisilni rad
- Seksualno zlostavljanje civila od strane srpskih vojnika prilikom zarobljavanja i u zatočeničkim objektima
- Uvođenje restriktivnih i diskriminacionih mera uperenih protiv hrvatskog, muslimanskog i drugog nerspskog civilnog stanovništva, uključujući osobe kao što su ograničavanje slobode kretanja; uklanjanje sa položaja vlasti u lokalnim institucijama državne vlasti i u policiji; otpuštanje sa posla; uskraćivanje prava na zdravstvenu zaštitu i samovoljni pretresi kuća;
- Mučenje, premlaćivanje i pljačkanje
- Namerno uništavanje domova i druge javne i privatne imovine, kulturnih ustanova, istorijskih spomenika i verskih objekata
Ovo je prva optužnica koju je ICTY podigao za zločine počinjene na području Vojvodine. Samo suđenje Šešelju trebalo bi trajati više od godinu dana, a odvijat će se u nešto laganijem ritmu - tri dana tjedno kako bi Šešelj imao vremena za pripreme. Tužiteljstvo će održati uvodne riječi 7. studenoga, a prve od oko 100 svjedoka izvest će 4. prosinca. Šešelj će, prema najavi, dati 8. studenoga izjavu optuženog jer se odrekao prava da iznese uvodnu riječ odmah nakon tužitelja, već će to učiniti na početku izvođenja dokaza obrane. Šešelj će, umjesto u klupi za optužene, sjediti u klupi rezerviranoj za odvjetnike optuženih jer je tražio da se pred svjedocima i publikom stvori "vizualni dojam ravnopravnosti s tužiteljima". Pitanje financiranja obrane još nije riješeno jer Šešelj odbija podnijeti izvještaj o svom imovinskom stanju koji je preduvjet da ICTY financira obranu. Po Šešeljevoj procjeni troškovi njegova pravnog tima premašili su 6,4 milijuna dolara. Šešelj je u pritvoru ICTY-a od dobrovoljne predaje 24. veljače 2004. godine
